菅义伟自2020年9月上台执政以来，一直在“保经济”和“保人命（疫情防控）”之间纠结摇摆，其内阁支持率则随疫情防控形势的好坏而上下波动，日本政情又随内阁支持率的变动而变化。菅义伟原本期望借助4月访美以及国会审议通过《数字化改革法案》来大幅提升内阁支持率，从而扭转被动局面，但不仅未能如愿，反而在4月25日举行的被称为众议院选举“前哨战”的国会补缺选举中败给在野党。再加上新冠疫情出现第四波高峰、东京奥运会屡遭国内外质疑等，菅义伟企图在2021年秋天连任的不确定性增加。

国会补缺选举全军覆没

　　4月25日，长野县参议院选举区、广岛县参议院选举区、北海道众议院第二选举区同时举行国会补缺选举。这是菅义伟政府成立后迎来的首次国会议员选举，也是任期即将届满的众议院选举的“前哨战”。其结果却是自民党候选人全部败给在野党。对自民党来说，这预示着即将到来的众议院选举将是一场苦战。
　　自民党在北海道众议院第二选举区是不战而败。自民党并未提名候选人参加竞选。该选区原是菅义伟亲信吉川贵盛众议员的选区，吉川在安倍政府中担任农林水产大臣期间，曾在大臣办公室接受养鸡企业的现金贿赂。遭媒体曝光后，吉川不得不称病辞职。自民党选举对策委员会对该选区选举形势进行评估后决定不提名候选人。
　　在选举前，自民党候选人在长野县参议院选举区就毫无胜算。该选区原是前首相羽田孜的儿子、立宪民主党参议员羽田雄一郎的选区，羽田雄一郎感染新冠病毒去世，其弟羽田二郎出马竞选。该选区一直是羽田家族的选举地盘，因此选举结果在选举前就已成定局。
　　备受关注的是广岛县参议院选举区。与前述两个选区补缺选举不同，广岛是无效当选而重新选举。该选区原是自民党内岸田文雄派资深政治家沟手显正的选区，沟手与安倍有宿怨，因此在2019年7月安倍支持时任法务大臣、众议员河井克行（其选区在广岛县）的妻子河井案里在沟手的选区出马竞选参议员。时任内阁官房长官菅义伟、自民党干事长二阶俊博也全力支持河井案里，而且以党的名义提供给河井案里的竞选经费竟高达沟手的十倍之多。河井克行还直接给多名自民党地方议会议员发放现金寻求支持，事后有24人承认收过河井的现金。在强大的竞选资金以及党内强势人物支持下，河井案里成功地将议席从沟手手中抢过来。涉嫌收买选票被曝光后，河井辞去法务大臣一职，随后夫妻双双被收监，因此广岛县此次是重新选举。由于该事件影响极其恶劣，从中央到基层自民党形象尽毁，可想而知不可能获胜，立宪民主党候选人当选。
　　自民党在“4.25”补缺选举中全军覆没，还意味着菅义伟内阁执政、二阶干事长对自民党的掌控都将面临更大压力。

疫苗接种赶不上疫情传播速度

　　日本传染病专家、政府新冠疫情应对专家小组组长尾身茂在国会答辩中指出，日本在4月13日进入第四波疫情：“由于受到感染力强的变异病毒的影响，与第三波相比，第四波暴发的规模更大。特别是五一黄金周长假的来临，人员流动频繁，5月以后感染人数超过第三波也不足为奇。”因此，菅义伟在访美归来后的第一件事就是准备再次宣布大阪、东京等部分地区进入紧急事态，期限从4月25日到5月11日，还有可能视情况延长。
　　第四波疫情形势相当严峻。从2020年1月6日日本国内出现第一例新冠病毒感染者，到2021年1月23日一年多时间，日本全国累计感染新冠病毒死亡人数5000多人。但从2021年1月24日至4月26日，三个月的累计死亡人数就超过了5000人。

　　日本疫苗接种进展缓慢。日本优先接种疫苗的群体是医护工作人员和老年人，其中医护工作人员为480万人，老年人数为3600万人。但截至4月26日，只有18%（87萬多人）的医护人员全部打完第二针，37%（176万多人）的医护人员打完第一针。老年人疫苗接种从4月12日开始，全部都道府县都进行了第一次接种。但截至4月25日，也只有大约7.5万名老人打完了第一针。
　　菅义伟访美归国后，日本上演“疫苗追加罗生门”。访美期间，日方计划安排菅义伟与美国辉瑞公司首席执行官见面会谈疫苗问题，却遭辉瑞方面拒绝，只好改为电话会谈。日本首相竟然见不到辉瑞公司首席执行官，这不仅打了菅义伟的脸，还严重伤害了日本人的自尊心。但是，为了宣传访美成果，菅义伟宣称电话协商取得成果，辉瑞公司同意在9月底前向日本追加提供1.1亿人份疫苗。然而，在4月20日的参议院厚生劳动委员会的答辩中，厚生劳动相田村宪久却承认并没有和辉瑞签订正式合同，只是口头约定。日本媒体致电辉瑞公司在日本的代表，对方也表示“追加提供疫苗尚在协商中”。菅义伟被批外交能力低下，连疫苗都无法筹集到。
　　在疫情防控面临严峻形势的同时，菅义伟在众议院答辩中又频繁出错。在4月12日众议院决算行政监视委员会的答辩中，菅义伟多次提到“防止蔓延等重点措施”，却一次都未能完整准确地说出措施的正式名称。立宪民主党议员质疑说“实在感觉不到首相对疫情防控的认真态度”。很多网民也对此感到惊讶，并认为菅义伟“根本没有领导能力”。

美国对东京奥运仍然态度暧昧

　　除疫情防控因素外，还有两个因素影响东京奥运会的举办。
　　一是自民党内部激烈的权力斗争。首相菅义伟和干事长二阶俊博，与前首相安倍晋三、财务相麻生太郎，这两大阵营暗地里进行着激烈的权力斗争，对奥运会举行造成了一定干扰。
　　二是菅义伟访美期间未能获得拜登出席东京奥运会的明确表态。菅义伟与拜登举行会谈后发表的共同声明中，有“拜登总统支持菅首相为举办奥运会所做的努力”的字句，但拜登这一表态实际上暧昧模糊、暗含玄机，并不是对“举办东京奥运会”本身的支持。在两人举办的共同记者会上，菅义伟说“会谈中我表达了成功举办奥运会的决心”，但拜登却对东京奥运会只字未提。有美国记者对菅义伟提出尖锐质疑：“从公共卫生的角度来看，推动举办奥运会岂不是不负责任吗？”菅义伟装作没听见，直接请其他记者提问。拜登也没有反应。当被问到“美方是否保证派运动员参加”时，菅首相始终以“得到了拜登先生的支持”来含糊其辞。奥运会召开在即，日本仍未能得到拜登本人参加或派美国运动员参加的明确表态。
　　这一系列事态发展都昭示着菅义伟未来将会考验不断。