目的 为完善我国基层医疗卫生机构补偿机制提供参考.方法 在全国选取山东、湖北、四川三省,采用问卷收集了60家基层医疗卫生机构财务数据,用SPSS完成统计学分析.结果 2011年我国基层医疗卫生机构总收入平均为457.1万元,比历史同期增长12.38％.药品收入为133.54万元,相比2010年下降12.70％,药占比由38.28％降为28.80％;政府投入为170.00万元,增长50.44％,占总收入比例由26.88％上升为36.32％;医疗业务收入增加不明显,但检查收入显著增加.政府投入增长显著,且在各地区水平均衡.结论 政府投入增加稳定了机构总收入,保障机构正常运营;要关注医疗机构检查收入的不合理增长:应提高政府投入的有效性,构建科学绩效考核制度,加强定量研究分析.