丙型肝炎病毒3'非编码区准种研究

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目的 获得中国大陆1b型丙型肝炎病毒(HCV)3′非编码区 (3′UTR)全长序列,探讨在丙型肝炎病毒3′非编码区(高变区)是否存在复杂的准种特性.方法利用逆转录套式聚合酶链反应(RT-PCR)限制性内切酶长度多态性分析(RFLP)初步筛选出6例1b型HCV感染者,采用半套式RT-PCR法扩增出约400 bp的cDNA片段,每例选择12~15个克隆测序.结果每例获得了5~8株全长1b型HCV3′非编码区克隆,由高变区,Poly(u)区,Poly(u/c)区及98碱基区四部分组成;各克隆中序列变异位点主要分布于高变区,Poly(u/c)区,核苷酸同源性0.2%~2.1%,呈现明显的准种分布特征.结论在丙型肝炎病毒3′非编码区(高变区)存在复杂的准种特性.

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