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基于全面协同的企业自主创新体系是指企业为了实现其关键核心技术的突破，取得产品和技术的自主创新而在其内部建立的创新组织、制度安排，以及与外部各创新协作主体和创新服务机构通过分工、合作形成的创新网络体系。企业自主创新体系建设是实现自主创新的前提基础和条件。文章结合创新相关理论提出我国企业自主创新体系构建应内外协同，即在企业内部建立全面创新管理体系，而在外部应建立有效的创新协作网络，内部创新体系和外部创新网络相互促进、互为补充，协同发展。