【摘 要】
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应用网络药理学技术和分子对接技术分析贯叶金丝桃(Hypericum perforatum L.)抗癌作用机制。采用中医药系统药理学(TCMSP)数据库和分析平台联合文献资料挖掘贯叶金丝桃抗癌的药效物质和药物作用靶标,在GeneCards数据库和OMIM数据库指认癌症相关靶标。采用生信可视化软件Cytoscape,使贯叶金丝桃药效物质与癌症蛋白靶标之间的关系可视化;利用String数据库对贯叶金丝桃
【基金项目】
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甘肃省科技计划项目(21JR11RM044); 陇东学院青年教师创新基金项目(XYZK1606);陇东学院青年教师创新基金项目(XYZK1814);
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应用网络药理学技术和分子对接技术分析贯叶金丝桃(Hypericum perforatum L.)抗癌作用机制。采用中医药系统药理学(TCMSP)数据库和分析平台联合文献资料挖掘贯叶金丝桃抗癌的药效物质和药物作用靶标,在GeneCards数据库和OMIM数据库指认癌症相关靶标。采用生信可视化软件Cytoscape,使贯叶金丝桃药效物质与癌症蛋白靶标之间的关系可视化;利用String数据库对贯叶金丝桃与癌症共有基因进行可视化分析,构建了PPI网络。借助R语言软件(V4.0.3)进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析。对主要药效物质和网络核心基因采用AutoDock Vina(1.1.2)软件进行分子对接,并采用PyMOL(2.5.1)软件进行可视化处理。结果共筛选出贯叶金丝桃抗癌主要药效物质9个、预测贯叶金丝桃抗癌作用靶标54个,贯叶金丝桃抗癌可能相关的信号通路有121条,贯叶金丝桃抗癌预测靶标主要为EGFR、IL-6、CASP3、MAPK8、INS、VEGFA。分子对接结果显示贯叶金丝桃抗癌药效物质与预测靶标之间具有较好的结合活性。这说明贯叶金丝桃可能对前列腺癌、膀胱癌、黑色素瘤、乳腺癌具有一定的防治作用,多种活性组分作用于机体的多个生物过程。这为进一步研究贯叶金丝桃抗癌作用药效成分及其作用机制,并促进其药用植物资源开发提供了理论依据。
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