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目的：建立小分子化合物毒性的三维定量构效关系模型，探索化合物毒性数据和三维结构参数之间关系的方法。方法：利用比较分子力场分析方法（CoMFA），建立了一组对发光菌有急性毒性的小分子的三维定量构效模型。结果：模型的交叉验证相关系数q^2=0．731，非交叉验证相关系数r^2=0．973，标准偏差SE=0．122，F=70．910。结论：该模型具有较好的预测能力，表明在甲基的邻对位减小取代基体积或电负性可以降低化合物毒性。