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选取48个典型的中成药大品种作为研究对象，利用万方数据库查找这些品种的科技投入与论文产出信息建立数据库。通过联用数据包络分析（DEA）和典型相关分析（CCA）方法，量化评估了DEA有效与DEA无效品种的科技投入与产出之间的关系。结果表明，各类科技项目对论文产出均有不同程度的促进作用，其中自然科学基金与省市项目的影响最大。同时，有效地验证了这类科技项目以论文产出为验收指标的合理性。