近几十年来，由于化肥的大量使用，造成土壤板结，土壤微生物减少，土壤營养状况越来越差。虽然化肥的投入量大得惊人，果树吸收利用率却很低，其大部分养分被土壤固定，被挥发淋溶，地面流失，造成土壤污染、环境污染比较严重，果树病虫害越来越重，果实品质下降风味差，严重影响了果业发展，制约了绿色无公害有机果品的生产。解决的唯一办法是增加果园土壤有机质，土壤有机质是土壤的重要组成部分，是土壤肥力的物质基础。有机质不仅含有稳定而长效的氮源物质，而且它几乎含果树和微生物所需要的各种营养元素。肥效期长而全面，能增强土壤的保水保肥能力，改善土壤的物理性质，促进土壤微生物的活动，促进植物的生理活性，减少农药和重金属的污染。
　　1 果园行间生草
　　可以改善果园小气候，果园生草在春天能够提高地温，促使根系较清耕园进入生长期提早15～30天；在炎热的夏季降低地表温度，保证果树根系旺盛生长，在秋季延长根系生长时间。行间生草可减少行间土壤水分蒸发和吸收，调节降雨中地表水的供应平衡，生长旺盛时刈割覆盖树盘保墒，并可防止水土流失，保墒蓄水，改善土壤物理性状，促进土壤团粒结构的形成，激活土壤固定营养元素的有效性，维持果园的生态环境。
　　（1）种植白三叶、红绿小豆等豆科作物，很多豆科作物有根瘤菌，能固定空气中的氮素，豆科作物生长中的氮素有1/3来自土壤，2/3来自根瘤菌的生物固氮，花期割倒或翻压，培肥土壤。
　　（2）种油菜，油菜以秋播为主，油菜根系深，可以把土壤的深层养分提到地表。春季开花前将其割倒覆在树盘下，留在土中的根茎，雨季可以蓄水在根茎内，腐烂后可以增加土壤养分。
　　2 果园秸秆覆盖
　　通过树盘覆盖，土壤地表可冬季保暖，炎夏降温，延长根系活动时间，减少水分蒸发，抑制杂草丛生，增加土壤养分。覆盖时间一般在5月上旬以后，地温回升时实施。覆盖物有粉碎的玉米秆、小麦秆，油菜荚、各种杂草锯末等。第1年每亩用秸秆800～1 000千克，以后每年用秸秆500～700千克，覆盖厚度一般15～25厘米，秸秆覆盖在果树树盘范围内，覆盖后撒少量土压实。连续覆盖3年后，土壤疏松，有机质含量明显提高，树势健壮，病害少。
　　3 增施有机肥
　　（1）农家肥。包括人粪尿、畜禽粪尿、厩肥等，发酵腐熟后（已没有臭味）再施入果园。在腐熟过程中，经过高温发酵杀死各种病原物，在微生物作用下逐步分解为简单的化合物，才易被果树吸收利用。
　　（2）沼气肥。是通过沼气池厌氧发酵后的肥料液，含有多种水溶性的氨基酸肥。营养成分相对富集，是一种速效的水肥，用于果树叶面施肥，收效快、利用率高。24小时内，叶片可吸收喷量的80%，能及时补充果树生长关键时期对养分的需求。叶片生长期喷施能增强光合作用能力，有利于花芽的形成与分化，花期喷施可保证花期所需营养，提高坐果率，促进果实生长，施入土壤也是很好的有机肥。
　　4 施用商品有机肥
　　（1）腐殖酸有机肥。以畜禽粪和城市污泥及生活垃圾、农副产品加工下脚料为主要原料，经过加入发酵微生物进行发酵脱水和无害化处理。它含有大量的维生素、多元酚、黑腐酸、黄腐酸、棕腐酸，还有细分子的有机酸、丁酸、甲酸、乙酸、氨基酸等多种酸和糖类及衍生物，这些物质除提供养分功能外，还可改良土壤的生理活性。
　　（2）生物菌肥。生物有机肥料中含有特殊功能的菌种是活的生命体，随着产品保存时间延长，特殊功能菌种的有效活菌数会不断减少。它可以补充土壤微生物的种群数量，加速土壤有机质的分解，腐殖质合成，养分转化和推动土壤结构的发展和形成，调节果树生长期的养分转化。
　　（3）有机无机复混肥料，它是由有机肥与化肥按一定的比例混合而成，是介于有机肥和无机肥之间的一种新型肥料，具备有机肥和无机肥的双重特点，具有适宜的供肥强度又能维持较长时间，能克服无机肥供肥大起大落农家肥供肥强度不足，肥效慢的特点。通过调节有机无机比例使供肥过程与作物生长的各阶段的需求相适应
　　5 果园养蚯蚓
　　蚯蚓是增强土壤有机质的最重要的动物，每年通过蚯蚓体内的土壤每公顷约有37 500千克干重。这些土壤不但其中的有机质可作为它们的食料，而且矿物质成分也受到蚯蚓体内的机械研磨和各种消化酶类的生物化学作用而发生变化。蚯蚓粪便中含有的有机质、全氮、硝态氮、代换性钙和镁、有效态磷和钾、盐基饱和度以及阳离子代换量都明显高于一般土壤（表1）。排泄的粪是有规则的长圆形、卵圆形的团粒，这种结构具有疏松、绵软、孔隙多、水稳性强、有效养分多并能保水保肥的特点。
　　蚯蚓的穿行活动可显著增强土壤的通气透水性，并将作为食物的叶片、植株搬运到土壤的深层，与土壤混合，更加速了土壤有机质的分解转化，促进结构的形成。蚯蚓的数量往往可以作为评定土壤肥力的因素之一，大量的蚯蚓是高度肥沃土壤的标志。