基于生物信息学分析微小隐孢子虫含WD40结构域的蛋白功能

来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：qq81194913

【摘要】

：

目的对微小隐孢子虫中含WD40结构域的蛋白进行生物信息学分析，分析该蛋白家族的WD40结构并预测其功能，为微小隐孢子虫基因功能的研究提供一定的基础理论。方法通过隐孢子虫基因

【作者】

：

陈川荆春霞张鲍欢张丽菊黄伟煌井立鹏东方杨光

【机构】

：

暨南大学医学院

【出处】

：

中国人兽共患病学报

【发表日期】

：

2014年6期

【关键词】

：

微小隐孢子虫 WD40结构域生物信息学分析功能预测

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目的对微小隐孢子虫中含WD40结构域的蛋白进行生物信息学分析，分析该蛋白家族的WD40结构并预测其功能，为微小隐孢子虫基因功能的研究提供一定的基础理论。方法通过隐孢子虫基因组数据库收集数据，获得微小隐孢子虫含WD40结构域蛋白家族的序列信息，搜索每个蛋白的CDD结构域并进行NCBIBLAST比对分析，确定为WD40结构域家族蛋白，分析结构域并预测功能。结果在C．parvum Iowa II中共搜索到50个含有WD40结构域的蛋白，其中cgd1_1930、cgd5_740和cgd4_3360含有CAF1C_

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