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主要从形态学标记、DNA分子遗传标记和蛋白标记这3个水平上综述了近年来学者们对黑龙江、长江和珠江三大水系间、长江水系内、野生群体与养殖群体间的草鱼遗传结构和遗传多样性的研究情况。得出了如下结论：草鱼的遗传多样性较低，野生群体较养殖群体遗传多样性高。通过研究草鱼的遗传多样性，最终以达到通过不同的标记方法来筛选遗传多样性高的标记位点，用于草鱼的分子辅助育种的目的。