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中国科学院知识创新工程重大项目是指以解决我国经济发展、国家安全和社会可持续发展的重大战略性科技问题为主要目标，与国家中长期科学和技术发展规划相衔接．能充分发挥中科院综合优势、广泛吸纳社会资源、多所多学科系统集成并有望产生重大科技成果的大型项目。重大项目采取顶层设计、统一规划、自上而下的组织方式，成熟一项，启动一项。