【摘 要】
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首先选择139个牛SNP标记,利用DNA池测序法,根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值>1/2);为了进一步验证筛选的准确性,对其中59个标记采用基
【机 构】
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北京市农林科学院畜牧兽医研究所,中国农业大学动物科技学院,鞍山恒利奶牛场,北京奶牛中心
【基金项目】
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国家科技攻关计划项目(编号:2011BAD28B02);现代农业产业技术体系专项资金(编号:CARS-37);长江学者与创新团队发展计划项目(编号:IRT1191);国家自然科学基金项目(编号:31172191)资助
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首先选择139个牛SNP标记,利用DNA池测序法,根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值>1/2);为了进一步验证筛选的准确性,对其中59个标记采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术检测了122头荷斯坦牛的基因型。结果显示,检出率高于85%的标记有56个,其平均最小等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)为0.41,最小值为0.27,最大值为0.5;MAF>0.3的标记有54个,占96.4%(54/56)。文章结果表明,采用DNA池测序法筛选高信息量SNP标记是可行和可信的。
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