猪(Sus scrofa)是一种重要的经济动物,研究发现瘦肉型猪的血清甲状腺激素水平高于脂肪型猪。Micro RNA(miRNA)参与调控多种生物学过程,但其在猪甲状腺激素调控中的作用尚不清楚。本研究以去势的120日龄的金华猪(脂肪型)和约克夏猪(瘦肉型)为研究对象,利用高通量测序技术分析其甲状腺组织中的miRNA表达情况,共检测到353个miRNA,包括293个已知miRNA和60个新预测的miRNA。其中有15个miRNA在两种猪的甲状腺中都高表达,这些miRNA被报道与甲状腺的生物学功能关系紧密。金华猪相对于约克夏猪存在18个差异表达miRNA,包括12个上调和6个下调。对差异表达的miRNA进行靶基因预测,共获得14 913个靶基因,经靶基因功能分析发现,这些miRNA主要参与了甲状腺激素合成、内吞作用、钙信号通路、过氧化物酶体和溶酶体等甲状腺激素调控相关的通路。本研究首次对猪甲状腺中miRNA表达谱进行了分析,将补充甲状腺激素调控网络中miRNA的作用,并在miRNA水平上为瘦肉型猪和脂肪型猪的遗传差异提供研究基础。