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目的 筛选家族性腺瘤性息肉病（FAP）的特异表达蛋白，构建判别FAP与散发性肠腺瘤的血清蛋白指纹图谱诊断模型。方法 采集19例FAP和16例散发性肠腺瘤患者的血清，以表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪（SELDI-MS-TOF）和阴离子CM01蛋白质芯片检测并筛选两组对象间的血清差异表达蛋白质峰，以支持向量机方法构建判别模型。结果 FAP与散发性肠腺瘤相比，P〈0.01的蛋白质峰有6个，其中质荷比为5640、3160、4180和4290的蛋白质峰在FAP中高表达，质荷比为3940和3400的蛋门质峰在散发性肠腺瘤患者中高表达。以质荷比分别为5640、3160和4290的蛋白质峰为基础，联合质荷比为3940、13750和4300的蛋白质峰所建立的模型判别效果最佳，对FAP与散发性肠腺瘤的判别准确率分别为94.7%和93.7%。结论 SELDI-TOF-MS能有效筛选FAP与散发性肠腺瘤的差异表达蛋白，支持向量机方法所建市的质潜模型判别效果较好，为进一步研究FAP的分子发病机制提供了切入点。