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科研能力作为评判高校优劣的重要因素，其在高校建设中占据不可动摇的核心位置。科研档案在高职院校所占据的比例较小，但其重要性不容置疑。现阶段高职院校档案管理工作存在诸多问题，制度化缺失、效率低下等严重影响科研档案的建立、管理与综合利用。本文通过对高职院校科研档案管理中存在的问题进行梳理，进而提出提高科研档案管理效率的对策，以期使科研档案在高职院校科研工作中得以发挥应有作用。