临床级致病基因的审核归档策略及其在下一代测序研究矮小症遗传病因中的应用实例

来源 :中华检验医学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:AEXSN
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目的

利用基因的审核归档策略进行矮小测序基因包设计。

方法

本研究详细介绍了基因审核归档策略,通过收集遗传学证据和功能证据,对基因-疾病关系进行分类,并且以身材矮小诊断基因包的设计为例,展示了基因审核归档过程对靶向测序基因列表设计的影响。

结果

通过基因审核归档,将机械搜索到的身材矮小基因包基因数量从1 276个精简到有效的705个,利用该基因包对全国371例身材矮小患者进行测序分析,诊断率可达到19.7%。该基因审核归档过程降低了假阳性的几率,同时在不影响诊断率的前提下降低了诊断成本和劳动时间。

结论

基因审核归档是二代测序诊断中的重要环节,应随着基因诊断的普及而得到广泛重视和应用。(中华检验医学杂志,2017, 40:500-504)

其他文献
下一代测序大力推动了无创产前检测的研究和应用。基于下一代测序的孕妇外周血浆胎儿游离DNA检测技术筛查胎儿患染色体非整倍体综合征(T21、T18、T13)的灵敏度高,假阳性率和假阴性率低,在全球广泛应用。性染色体非整倍体、常见染色体微重复微缺失综合征以及一些单基因病的无创检测也已在技术上实现。未来NIPT面临的主要挑战将不在技术层面,而在于配套服务和监管的完善。(中华检验医学杂志,2017, 40: