【摘 要】
：
目的对上海市柯萨奇病毒A6型(CVA6)流行株的基因进化和选择压力进行分析，为今后手足口病的防治提供理论依据。方法选取美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库中的CVA6参考序列，与2011—2015年上海地区CVA6流行株的VP1基因序列进行比对，采用MEGA软件构建进化树；扩增2014—2015年上海地区CVA6流行株的全长基因序列，采用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值，用Datamon
【机 构】
：
201508 上海，复旦大学附属公共卫生临床中心；上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心,上海交通大学医学院附属新华医院,上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心,上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心
论文部分内容阅读
目的对上海市柯萨奇病毒A6型(CVA6)流行株的基因进化和选择压力进行分析，为今后手足口病的防治提供理论依据。
方法选取美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库中的CVA6参考序列，与2011—2015年上海地区CVA6流行株的VP1基因序列进行比对，采用MEGA软件构建进化树；扩增2014—2015年上海地区CVA6流行株的全长基因序列，采用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值，用Datamonkey在线软件预测正向选择位点。
结果基于VP1基因序列的进化树显示2011—2015年上海地区的CVA6流行株为D3、D6和D7亚型，2014年后为D7亚型。氨基酸置换熵值计算共获得39个熵值>0.6的位点。选取FEL和IFEL模型分析分别发现3个和4个正向选择位点，VP1的595位和3D区的1 999位为分析获得的共同氨基酸变异位点。
结论2014—2015年，上海地区流行的CVA6属于D7亚型，VP1区未出现显著的基因变异，应继续保持对上海地区CVA6的基因进化趋势研究并密切关注基因变异情况。
其他文献
老年群体需要有一定的文体活动丰富日常生活,一般选择老年大学的声乐课程,缅怀青春.但由于老年人接受教育程度不同,对音乐的感受和体会不同,还有声带老化等原因,导致他们不能
最近，由山西春城乳业有限公司精心研制而成的一种专门为女性饮用的“女士酸奶”已闪亮上市，成为全国第一个专为女性开发的饮料产品，深得女士们的喜爱。随着人们饮食结构的改变，现
君山以湖光山色的秀丽而闻名于世，更以君山茶之奇珍举世闻名。君山茶自古以来得到了文人墨客的推崇，受到消费者的青睐，逐步发展形成为有地方特色的君山茶文化。君山茶文化是湘茶
本文对职业英语技能大赛背景进行研究,介绍我国职业英语技能大赛发展概况,阐释职业英语技能大赛赛项设计理念,在对比赛项目和内容剖析的基础上,开展职校英语课堂教学改革实践
在著名的米酒故乡-湖北孝感，有一家公司生产的孝感米酒、黑珍珠米酒、黑珍珠饮料、牛奶饮料等产品，深受广大消费者的青睐。尤其是在目前国内饮品市场竞争十分激烈的情况下，该公
虽然GaN基的蓝绿色发光器件已经取得成功,但是高效率的深紫外LED器件发展缓慢。InAlGaN材料被用于深紫外发光器件的有源区,AlN和高铝组分的AlGaN薄膜则是深紫外发光器件
阅读贯穿学生整个学习生涯,提高阅读教学的有效性、培养学生的阅读能力是初中语文教学的重中之重,同时这也是新课程改革的关键点.但是在实际教学过程中,阅读教学的地位并不高
英语是一门语言,在英语学习中,词汇是英语的重要基础,词汇量的掌握直接影响了英语水平,支架式教学有助于高中英语词汇教学.近年来,随着教育水平的提升,对于高中生英语词汇量
基于提高项目管理效益水平的目的,围绕BIM技术的应用,采取实例分析方法,做简单的论述,总结BIM技术的应用形式和作用,提出增强项目管理与BIM技术融合深度的策略,共享给相关人
我们国家在语文教学中,一直在进行着创新工作.在创新的过程中,出现了群文阅读的教学方法.群文阅读的教学形式能够帮助学生们提高学习阅读的兴趣,提高学生们理解和分析阅读的