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对土壤生态系统的影响是Bt棉环境安全评价的重要内容。Bt棉表达的毒蛋白可以通过根系、植株残体等途径进入土壤生态系统，与土壤颗粒结合，并长时间保持杀虫活性。因此，残留在土壤中的毒蛋白可能对土壤特异生物功能类群产生影响，破坏土壤生态系统平衡。但目前对Bt棉土壤中残留的毒蛋白进行检测尚无有效的检测方法。作者初步研究了Bt棉土壤残留毒蛋白的检测方法，旨在建立Bt棉土壤残留毒蛋白检测技术规范，明确土壤残留毒蛋白的降解动态，为Bt棉环境安全评价提供科学依据。