基于清风藤属植物DNA条形码的叶绿体序列筛选

来源 :种子 | 被引量 : 0次 | 上传用户：WQR712

【摘要】

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基于叶绿体基因matK、psbK-psbI、psbA-trnH序列分析9种清风藤属植物DNA条形码可行性。结果表明,清风藤属3条叶绿体基因中,matK序列最长(805 bp);psbA-trnH序列的GC含量最低(

【作者】

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严福林温迪王波徐文芬孙庆文魏升华

【机构】

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贵州中医药大学药学院

【出处】

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种子

【发表日期】

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2020年5期

【关键词】

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清风藤属 DNA条形码 MATK psbK-psbI PSBA-TRNH Sabia DNA barcoding matK psbK-psbI psbA-trn

【基金项目】

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国家自然科学基金(81560707),国家自然科学基金喀斯特联合项目(U1812403-2-1),贵州省国内一流学科建设项目(GNYL[2017]008),贵州省普通高等学校工程研究中心项目(黔教合KY字[2017]018),贵州省优秀青年科技人才项目(黔科合平台人才[2019]5658),国家中医药管理局资助项目(国中医药科技中药2014~117号)

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基于叶绿体基因matK、psbK-psbI、psbA-trnH序列分析9种清风藤属植物DNA条形码可行性。结果表明,清风藤属3条叶绿体基因中,matK序列最长(805 bp);psbA-trnH序列的GC含量最低(29.7%),变异位点数(46)与简约信息位点数(32)最多。种间变异顺序为:psbA-trnH>matK>psbK-psbI;种内变异顺序为:psbA-trnH>psbK-psbI>matK。遗传距离分析、barcoding gap分析与Wilcoxon秩和检验分析结果

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