基于microRNA-mRNA相互作用的直肠癌预后标志物的研究

来源 :广西医科大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：aszxc1986

【摘要】

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目的:通过microRNA-mRNA相结合探讨直肠癌潜在的关键差异基因和预后标志物。方法:从基因表达汇编公共数据库(GEO)获取microRNA芯片数据,分析获得差异表达microRNAs(DE-miRNAs

【作者】

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邵梦楠郑盛锋贡益敏韦怡张明津刘佳艺杨小丽

【机构】

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广西医科大学医学科学实验中心,广西医科大学第一附属医院,桂林医学院科学实验中心

【出处】

：

广西医科大学学报

【发表日期】

：

2020年4期

【关键词】

：

直肠癌 GEO数据库 MIRNA 关键差异基因 CCND1 rectal cancerGEO databasemiRNAkey differential gen

【基金项目】

：

国家自然科学基金资助项目(No.81160097)

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目的:通过microRNA-mRNA相结合探讨直肠癌潜在的关键差异基因和预后标志物。方法:从基因表达汇编公共数据库(GEO)获取microRNA芯片数据,分析获得差异表达microRNAs(DE-miRNAs)及其靶基因。对差异基因进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,建立差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,鉴定出关键差异基因,再进一步评估关键差异基因的表达水平和预后作用。结果:总

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