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以花椰菜9901A×9908杂交种为材料，用高盐低pH值法提取的基因组DNA为模板，时ISSR-PCR反应体系中的铗离子浓度、dNTP浓度、Taq DNA聚合酶量、引物用量以及最适退火温度等影响因子进行了优化和筛选。建立了适合花椰菜的ISSR反应体系：20μL PCR反应体系，含10×PCR反应缓冲液2μL，2．0mmol／L MgCl2，4×dNTP混合物0．2mmol／L，引物0．5μmol／L，Taq酶1．5U，基因组DNA约30ng，最适退火温度为52．8℃。