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对樱桃谷鸭和麻鸭及其杂交子代（樱♂×麻♀）3个样本的基因组DNA进行了RAPD标记分析，探讨了杂种优势产生的分子遗传机制。从120个随机引物中筛选出20个引物进行扩增，460条扩增带中，有330条带具有多态性。群体内相似性指数分别为0．7888（樱桃谷鸭）、0．7629（麻鸭）和0．8227（F1）。F1与母本的相对遗传距离为0．3300，与父本为0．3505，表明F1偏向母本。