【摘 要】
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目的 基于GEO数据库挖掘先兆子痫(PE)患者外周血潜在标志物及可能机制.方法 从GEO数据库中收集PE人群研究的外周血mRNA基因芯片GSE48424,共计36例,并根据是否发生PE将其分为
【机 构】
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天津医科大学研究生院,天津300070;天津市心血管重塑与靶器官损伤重点实验室中国人民武装警察部队特色医学中心心血管病研究所,天津300162
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目的 基于GEO数据库挖掘先兆子痫(PE)患者外周血潜在标志物及可能机制.方法 从GEO数据库中收集PE人群研究的外周血mRNA基因芯片GSE48424,共计36例,并根据是否发生PE将其分为两组,即PE组和对照组.在GEO2R平台内对各组的数据进行差异mRNA基因分析,剔除| Log2 Fold Change |＜1、修正P值＞0.05以及信息不完整的基因数据,将筛选出的差异基因导入String在线数据库完成基因本体(GO)富集分析,并获得差异基因所编码的蛋白质之间的相互作用.结果 筛选出差异基因65个,其中Toll样受体4(TLR4)和GTP环化水解酶1(GCH1)是处于网络核心的蛋白.差异基因主要参与的生物学过程包括对脂多糖的反应、对肿瘤坏死因子的反应、转化生长因子β生成的积极调节、Toll样受体信号通路的正调节和烟酰胺代谢过程;主要富集的细胞组分是神经元投射、突触小泡、高尔基体、质膜的整体成分和内质网;主要发挥的分子功能包括受体活性和蛋白质结合.结论 PE的发生可能与对脂多糖的受体活性调节有关,TLR4和GCH1可作为外周血中的潜在标志物.
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