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采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术及产物序列分析方法,比较研究南海新村湾3个站位海草沉积物中细菌群落组成及分布。结果表明：根据DGGE图谱代表的遗传多样性显示春季二号和春季三号站位样品相似度最高为81.5%,秋季一号和秋季三号站位样品相似度最低为29.3%。春季和冬季细菌多样性指数较高,其Shannon指数范围分别为3.03~3.07和3.23~3.35。通过对16S r DNA V3高变区域42条条带克隆测序比对,结果显示：海草沉积物细菌类群主要分布在变形菌门（Proteoba