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肺炎衣原体为１９８９年命名的衣原体属内的一个新种。近年来，有关肺炎衣原体的分子生物学研究取得了许多进展，特别是它的脂多糖（ＬＰＳ）和外膜蛋白、热休克蛋白的组成及其抗原性，基因的克隆与表达及其序列分析等研究已逐步深入；多聚酶链反应（ＰＣＲ）技术的应用也为肺炎衣原体实验室诊断开辟了快速而准确的途径。