【摘 要】
：
目的 建立适用于扩增我国常见的乙型肝炎病毒(HBV)A～D基因型全长逆转录酶(RT)区(包含全长HBsAg编码区)的聚合酶链反应(PCR)法,并确定其在分析临床标本中的应用价值.方法 建立
【机 构】
：
北京大学医学部病原生物学系,北京市海淀医院感染疾病科,北京大学第三医院感染疾病科,北京市地坛医院
【基金项目】
：
国家重点基础研究发展计划(973计划);
论文部分内容阅读
目的 建立适用于扩增我国常见的乙型肝炎病毒(HBV)A～D基因型全长逆转录酶(RT)区(包含全长HBsAg编码区)的聚合酶链反应(PCR)法,并确定其在分析临床标本中的应用价值.方法 建立我国HBV基因序列库,设计适用于扩增A～D基因型HBV全长RT区引物,以A～D基因型HBV重组质粒为模板建立半巢式PCR(snPCR)法,并确定该法灵敏度.用所建立的snPCR对44份HBV DNA定量阳性(>5.0×102 拷贝/ml)慢性乙型肝炎患者血清标本进行扩增及PCR产物直接测序.结果 琼脂糖凝胶电泳及测序证实,snPCR可扩增A～D基因型HBV全长RT区,对A、B、C和D基因型HBV质粒扩增的灵敏度分别为1.2×103、7.0×102、6.0×102和6.0×102 拷贝/ml.snPCR检测HBV DNA >5×102 拷贝/ml血清标本的阳性率为88.64% (39/44),扩增阴性血清标本HBV DNA滴度均处于103 拷贝/ml水平.扩增目的 产物经直接测序确证无误.生物信息学分析显示,样品中B和C基因型分别占35.90%(14/39)和64.10%(25/39);其中15.38%(6/39)发生RT区变异,包括4例为已知耐药变异;7例(17.95%)存在HBsAg编码区变异,其中2例为已知免疫逃逸变异;6例(15.38%)发生RT区和HBsAg编码区"镜像改变".结论 建立了一种新的扩增全长RT区(涵盖全长HBsAg编码区)的snPCR.该法结合直接测序法,可同时分析我国HBV A～D基因型已知和潜在的耐药变异位点.
其他文献
随着"神舟五号"飞船的顺利升空,"杨利伟"商标成为商家的抢注目标,据悉,有关部门为了保护扬利伟的权益,已向商标局进行了商标注册.本文结合商标法的有关规定及人格权的相关理
近4年取得的经济成就表明,普京提出的经济改革新道路和体制模式比较符合俄罗斯的国情,推动了经济和社会的发展。因此,普京在新任期将坚持既定的改革道路和经济体制模式。一
应用基于全寿命成本的价值分析技术,将寿命周期中各项成本的不确定性也作为衡量方案优劣程度的因素,根据各项成本的概率分布,利用蒙特卡罗仿真技术计算各方案全寿命成本的分
通过对货轮沉船事故原因的调查研究,判定事故发生的直接原因是由于船体存在的潜在缺陷,分析了船舶管理不当可能是导致潜在缺陷的原因。对公司、船舶提高管理水平、控制人为疏
讨论了焊接结构疲劳寿命预测的的两个必要条件、基本内容和方法.基于铁路工厂广泛使用的有限元分析软件的二次开发功能及编程工具,将国际上著名的焊接结构疲劳评估标准的相关
尽管我国宪法监督制度的发展步履维艰,然而经过二十多年的宪政建设,一种符合中国国情的宪法监督制度已经初露端倪,在宪法监督主体、违宪审查方式及违宪制裁措施等诸多方面呈
苏联剧变的根本原因是斯大林--苏联社会主义模式丧失了动力机制,走进了死胡同.人们在抛弃这个模式的同时,也抛弃了作为国家领导核心力量的苏共.这是因为,在斯大林体制模式条
本文根据世界银行关于投资环境的分析方法,以杭州市为案例分析了杭州市三大方面的投资环境政策改革以及推动投资环境政策改革的八项机制
电子政务近年来在全球发展迅猛 ,在我国亦有较大发展。作为新型的政府运作模式 ,它必然要给传统的行政法带来巨大的震荡和冲击。这也正是行政法的发展动力之所在。本文从电子
传统聚落色彩景观是特定地域文化的极佳视觉传达.在旅游开发中,传统聚落色彩景观可以构成不同旅游地鲜明的个性标识,传递其独特的美学思想并再现其久远的历史积淀.在正视旅游