华盛顿的第二个总统任期，首先遇到的挑战就是内乱。为了偿还债务，1791年，联邦政府开始向威士忌酒征税，遭到西部农民的激烈反抗。1794年8月，匹茨堡附近的6000多名农民聚集起来集体抗税，华盛顿亲自领兵前去镇压，他成了美国历史上唯一在自己国土上率兵出征的在职总统。
　　叛军不战而降。华盛顿提出，只要参加反叛的人签署誓言，愿意重新遵守联邦法律，他们就能立即获得赦免。
　　华盛顿最终免除两个叛乱首领的死刑，以不流血的方式，结束了这场内乱，避免了仇恨的延续。
　　为了国家的长远利益，他力排众议，批准汉密尔顿的经济政策，并与英国签订《杰伊条约》。如果说财政政策带来的危机，被有些人解释为华盛顿年老体衰，被人利用，那么《杰伊条约》的签订，则实实在在地损害了华盛顿的名誉。
　　有史家称，美国历史上没有哪一部协定像《杰伊条约》那样，签署时遭人唾弃，之后却得到赞许。
　　1793年，英法再次开启战事，华盛顿采取中立政策。由于法国大力支持美国的独立战争，因此，美国的亲法派人士对华盛顿大为不满，尤以杰斐逊为代表，他为此辞去国务卿职务。到1794年，美国采取的中立政策，不仅让法国人愤怒，而且遭到英国人的挑战，英军在加勒比海附近拦截美国商船，在美国西北边界制造事端，不断鼓动俄亥俄的印第安部落，反对华盛顿的安置政策，致使美国边疆无法安宁。
　　1794年4月，华盛顿派杰伊赴伦敦求和，希望避免与英国发生战争。因为他太清楚，以美国的实力，无论如何都承担不起跟英国的第二次战争，他希望不计代价地爭取让英国从美国西北边境撤军。
　　尽管华盛顿已经做好心理准备，但看到对方拟定的条约，他大失所望。条约承诺英军将撤离美国，作为回报，美国须单方面给予英国商品以最惠国待遇，等于间接承认英国的海军和商业霸权地位，甚至答应偿还独立战争前殖民地人欠下的债务。在很多人看来，这等于是重新回到殖民时代。
　　在独立战争最艰难的时刻，法国人出手相助，帮助大陆军赢得最后的胜利。独立后的美国人，对英国自然颇有敌意，法国人之前的慷慨相助，以及法国大革命的激荡宣言，赢得了不少美国人的心。
　　《杰伊条约》的内容，明显偏向英国，可以说是对1778年法美联盟的否定。条约公之于众后，约翰·杰伊成了卖国贼，华盛顿受到咒骂。虽然华盛顿对条约规定的细则感到不满，但他很明智地看到《杰伊条约》最大的成果，就是英国将从美国撤军。美国虽然损了颜面，却能缓和与强敌的关系，保证西部领土不受干扰，为美国向西扩展打下坚实的基础。
　　华盛顿决定忍辱负重，签署条约，为美国赢得和平发展的机会。欧洲从不是华盛顿关注的重点，他一心想着在北美大陆的发展，尽管无人知道美国西部大陆的情况。华盛顿坚信，美国的未来是要向西发展，而不是向东求和。这一条约表明美国政府选择英国作为贸易伙伴，说明它认定未来的世界霸主将是英国，这是具有远见的战略决策。美国与英国的矛盾，因该条约的签订得到缓和，这为这个新建的国家赢得经济和政治上发展的机会，有效推迟了第二次对英战争。华盛顿的这一远见，当时只有很少的人能理解，美国国内的反对声音特别大。
　　杰伊曾说，他晚上沿东部海岸行走，不需要点灯，因为一路上都有抗议者在焚烧他的纸人像。
　　众人反对的条款竟然成了合法的条约，杰斐逊不甘心，他提出众议院有裁决一切法案和条约的权力，尽管他说不出宪法哪项条款赋予众议院这样的权力。麦迪逊到底是法律专家，他指出众议院有权决定所有经济类法案，可以通过否决《杰伊条约》中的赔款，间接破坏这一条约。
　　1796年春天，纽约州的罗伯特·利维斯顿要求华盛顿上交所有跟条约签订有关的文件，以供众议院讨论。华盛顿拒绝了这一要求，认为它会破坏“三权分立”的原则。同时，华盛顿质疑众议院，是否有权力干涉条约签署？
　　麦迪逊并不畏惧华盛顿的权威，他主持众议院的辩论和投票。会前，麦迪逊信心满满，以为自己能够赢得足够的选票否决赔款，毕竟对这一条约的反对声不绝于耳。投票结果却是51∶48，众议院以微弱优势通过这项条约，华盛顿的威望可见一斑。
　　在《杰伊条约》长达两年的发酵过程中，华盛顿本可保持沉默，置身事外，让杰伊承担后果，但是华盛顿知道此事事关重大，一旦与英国失和，国家就会陷入战争泥潭，无法自救。因此，华盛顿不仅没有在汹涌的民意前退却，还向前一步，不惜以自己的名誉，抵挡各方阻力。
　　华盛顿说：“我要避免战争。如果不能避免，我要为准备战争赢得时间。”
　　历史已经证明，华盛顿的深谋远虑，为美国赢得与英国抗衡的时间。没有十年的准备期，美国要想赢得1812年的对英战争，是不可想象的。
　　因为签订《杰伊条约》，华盛顿忍受了美国各地寄来的抗议书和报纸上不堪入目的辱骂与诅咒。表面上，他对各种批评充耳不闻，内心却非常受伤。此事过后，正好华盛顿第二届任期已满，他坚决辞去总统职务。告别词数易其稿，表明华盛顿受到民众误解后，难平心中愤懑。
　　（摘自《绅士谋国》）