目的分析胃癌前病变患者口腔中唾液和牙菌斑样本的细菌多样性,以期获得口腔菌群特征与胃癌的相关性的科学证据。方法选取约定进行上消化道内窥镜检查的97名应试者。按病理诊断结果,将受试者分为2组,对照组无任何病理变化;病变组患有胃癌前病变(包括慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生或异型增生)。提取唾液和牙菌斑样本DNA,进行巢式PCR变性梯度凝胶电泳,采集DGGE图像,BioNumerics软件分析图像,SPSS17.0统计软件分析微生物学指标和细菌多样性之间的相关性和相似性。结果胃癌前病变患者的龈下菌斑样本的DGGE条带数(35.6)显著高于对照组(33.2)(P<0.05),但2组间唾液样本的DGGE条带数量,未见显著性差异。所有受试者的6个不同牙位点龈下菌斑之间的相似性达80.7%,而唾液和龈下菌斑集合2种不同来源样本的菌群相似性只有78.0%。病变组唾液样本和龈下菌斑样本的相似程度(76.5%)略低于对照组(78.6%);病变组不同牙位龈下菌斑样本之间的相似程度比对照组略高。结论胃癌前病变患者口腔中龈下菌斑的细菌多样性略高于对照组,不同牙位龈下菌斑细菌多样性的相似程度高于唾液和龈下菌斑。