论文部分内容阅读
目的
筛选RA患者外周血中差异性表达的环状RNA(circRNA)并进行生物信息学分析,以探讨外周血circRNA在RA发病中的作用。
方法采用circRNA芯片对3例RA患者和3名健康对照的外周血中的circRNA进行筛查,用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理,通过Fold Change和P值进行筛选,采用t检验,寻找2组样本间差异表达的circRNA,并对差异表达的circRNA进行生物信息学分析。
结果芯片筛查结果提示有36个circRNA在RA组和对照组之间差异有统计学意义,14个circRNA下调,22个circRNA上调。对这些circRNA所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析,结果提示,这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等。对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预测,其中有1个circRNA(hsa_circ_0005397)预测结果中有1个miRNA(hsa-miR-125a-3p)在文献中得到验证,用Cytoscape软件对三者之间的网络关系进行了预测。
结论RA患者外周血中的circRNA出现多个差异性表达,circRNA可能参与RA调控机制。