在没有发生重大经济事件的情况下,2013年起中国南北经济差距逐渐拉大;2016年起,在经济总量差距进一步拉大的情况下,南北地区的全要素生产率却开始趋同.探明南北差距扩大的原因并提出解决之道是摆在全面建成小康社会决胜期的一道难题.通过对中国经济增长历程的梳理,本文发现新时代南北差距问题本质上是经济增长方式转型的老问题.实证研究表明:1998年至2018年资本贡献了74.7％的中国经济增长,而全要素生产率只贡献了8.3％,在转变资本拉动型增长方式的过程中,南北地区承受了不同的阵痛,导致南北差距扩大.在“三期叠加”阶段,南北差距扩大具有一定的必然性,2008年世界金融危机仅仅是导火索,其后的经济刺激计划则形成了短暂的隔离带,将南北差距问题推迟到2013年.2016年起南北全要素生产率差距的缩小得益于供给侧结构性改革,改革的有效性在本文得到验证.基于实证分析结论,本文认为要继续推进供给侧结构性改革,重视企业尤其是创新型企业的集聚,以此为抓手促进创新型要素在北方的培育和高效利用.