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菊科是中国帕米尔高原第一大科,共有36属139种及1亚种5变种,植物生活型以地面芽植物为主,高达85.6%;中国帕米尔高原菊科植物区系地理成分多样,有8个分布类型和6个变型,温带性质明显,以北温带为主,缺乏热带分布型和中国特有分布型;与其它植物区系相比,西帕米尔与中国帕米尔的相似系数最高;该区菊科植物特有现象不明显。