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针对时间交替采样系统（TIADC）通道失配的校准问题，分析了TIADC通道失配现象误差的特征，建立了基于参考通道的系统校准模型，提出了一种多频参考误差法，通过快速频率估计及数值查表过程，即可完成有效的误差校准。进一步讨论了方法在系统全输入带宽内的适用性及其校准性能。实验仿真表明，多频参考误差法可将TIADC系统无杂散动态范围提高至少25dB。