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针对标校数据中系统误差和随机误差的特性,提出将小波分析方法应用于误差的分离过程中。给出小波变换分离随机误差的方法,在阈值优选时采用GCV(广义交叉验证)准则,并将免疫算法应用于阈值的寻优过程,利用MATLAB软件编制程序实现了随机误差的分离仿真。在免疫算法的选择操作时,通过计算抗体期望繁殖率,保证了群体的多样性,从而使算法更加稳健,在提高搜索效率的同时减少陷入局部最优的机会。仿真结果表明,利用小波变换方法,采用GCV准则确定阈值,可以很好地完成误差的分离,有一定的应用前景。