工资总额管理是工资管理的重要组成部分，对事业单位坚持公益性质，开展国家和社会赋予的各项职责，起着基础性制约作用。新中国成立后，工资总额管理先后经历了4个不同的历史时期，当前，绩效工资总量管理承担起了工资总额管理的历史性责任。现今，绩效工资总量管理是滞后的，国家各相关部委相继出台了多项政策，突破或绕过了绩效工资总量管理，为绩效工资总量管理带来了挑战。在实际执行绩效工资总量管理过程中，面临着激励不足、人才吸引力不足、限制绩效激励分配机制改革和单位自主权的现状。针对绩效工资总量管理过程中，无法差异化、市场化核定绩效工资总量以及无法根据事业单位业绩贡献核定绩效工资总量和精准调控绩效工资的问题。建议科学规范核定绩效工资总量，建立事业单位绩效考核管理制度和动态调节绩效工资总量管理制度。但是，要想建立更加科学和规范的薪酬管理体系，单一的解决绩效工资总量管理自身所面临的问题是不够全面的，需要更深层次的改革工资管理和确定机制。