全伸展DNA链折叠过程中三种非线性作用的布朗动力学模拟

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脱氧核精核酸(DNA)单分子链从完全拉伸状态折叠到平衡状态的动力学过程是溶液中DNA单分子力学的重要特征之一.通过构建全参数化的珠子-弹簧分子链模型,并运用一种高效平衡的半隐式预测——校验积分算法,系统研究了体积排斥作用、有限伸长弹性作用和涨落流体动力学作用等三种非线性作用对稀溶液中DNA分子链折叠过程朾对回旋半径和驰豫时间的影响程度和变化趋势.模拟结果发现:体积排斥作用不影响分子链的折叠驰豫时间,但能显著碱小平衡时的相对回旋半径;流体动力学作用不影响分子链的相对回旋半径,但明显缩短折叠过程的驰豫时间;有
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