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实现船舶电力系统的快速供电恢复是一个复杂的多目标非线性组合优化问题。为了解决船舶电力系统发生故障时供电恢复问题，采用了免疫克隆算法，并对算法的变异算子进行了改进，改进后的变异算子把高频变异和柯西变异有效的结合在一起，兼顾全局搜索和局部搜索，吸取了遗传算法并行搜索优点，提高了搜索效率和收敛性。船舶电力系统典型故障恢复算例表明，该算法具有很高的搜索效率和寻优性能，能有效地提高供电恢复的速度及精度，较好地实现船舶电力系统的故障恢复。