运用全基因组表达谱分析筛选肺腺癌不同TNM分期相关基因的研究

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目的

比较不同TNM分期肺腺癌样本的基因表达谱,筛选中国人肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因。

方法

采用病例-病例研究。选取第三军医大学西南医院2008年5月至2011年10月经手术切除治疗的240例肺腺癌患者。其中90份患者标本(TNMⅠ期、Ⅱ期、ⅢA期各30例)用于芯片杂交,其余150份患者标本(TNMⅠ期、Ⅱ期、ⅢA期各50例)用于后续验证研究。应用商品化的博奥晶芯®35 K Oligo基因芯片比较90例不同TNM分期肺腺癌的基因表达谱,筛选与肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因。从中挑选Zimp7、GINS2及NAG-1共3个差异表达基因,应用实时荧光定量RT-PCR方法进一步验证它们在肺腺癌组织标本中的表达情况。受检基因在各期中表达水平的比较采用方差分析。

结果

肺腺癌组织中共筛选到592个显著差异表达基因;其中264个肺腺癌相关高表达基因和328个低表达基因。在这592个基因中,进一步筛选不同TNM分期(Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期)样本间的差异表达基因,共获得10个显著差异表达基因。实时荧光定量RTPCR方法验证结果与芯片结果基本一致。

结论

本研究共筛选到10个中国人肺腺癌TNM分期相关作用基因,预期将为揭示肺腺癌发生发展的内在作用机制,寻找肺腺癌诊断、治疗、预后判断的新靶点提供思路。(中华检验医学杂志,2013,36:1104-1108)

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