【摘 要】
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运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测
【机 构】
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海南大学农学院,中国科学院昆明动物研究所/遗传资源与进化国家重点实验室
【基金项目】
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海南省自然科学基金（310036）,海南省教育厅高等学校科学研究项目（Hjkj201l一11）,海南大学青年基金（qnjjl017）,海南大学科研启动项目（Kyqdl116）
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运用PCR产物直接测序的方法对海南省文昌市90只文昌鸡样品的线粒体DNA控制区（mtDNA D-loop）第Ⅰ高变区序列进行了分析。用CLUSTAL X 1.81软件进行序列比较,其中38只个体共检测到27个核苷酸多态位点,全部为转换无颠换,序列突变率为5.29%。用DnaSP软件估计出序列存在16个单倍型,单倍型多样度（Hd）为0.935,核苷酸多样度（π）为0.01479,平均核苷酸差异数（k）为7.541。运用Mega4.0软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了NJ系统树。文昌鸡样品在NJ无根
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