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目的:利用二代测序技术(next-generation sequencing,NGS)比较分析人类免疫缺陷病毒(human immu-nodeficiency virus,HIV)感染者和HIV未感染者口腔唾液中真菌微生物物种组成和多样性差异.方法:收集30例HIV感染者(HIV组)和30例HIV未感染者(对照组)的非刺激性口腔全唾液,采用Illumina NGS测序技术分析其物种多样性和群落组成差异.结果:Illumina NGS高通量测序共获得3450194条有效序列,采用Unoise3降噪得到4374个zOTU(zero-radius operational taxonomic units).经物种注释获得11个门,279个属和298个种水平的物种.HIV组的Alpha多样性指数Chao1和Shannon显著高于对照组.轮枝孢属、曲霉属、伊萨酵母属、链格孢属等在对照组显著富集,念珠菌属、被孢霉属、马拉色氏菌属、青霉属、拟青霉等在HIV组显著富集.结论:HIV感染组口腔唾液中真菌微生物物种丰富度和多样性显著高于HIV未感染组.两组真菌微生物的门水平和属水平优势物种均存在较大差异.HIV感染可能会造成口腔唾液微生态失衡.