【摘 要】
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目的利用RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)进行丹参酮ⅡA促食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)Eca109细胞凋亡的转录组学研究,探讨可能的分子机制。方
【基金项目】
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河南省教育厅科学技术研究重点项目(14B360001);河南省科技攻关项目(172102310091)
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目的利用RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)进行丹参酮ⅡA促食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)Eca109细胞凋亡的转录组学研究,探讨可能的分子机制。方法丹参酮ⅡA(8μg/ml)处理Eca109细胞48 h,空白组作为对照,进行高通量转录组测序分析,筛选差异基因,分析转录组表达谱,利用GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集方法探讨丹参酮ⅡA促进Eca109细胞凋亡分子机制。结果转录组测序分别获得包含28,667,820、27,830,388条过滤后测序读数,构建测序文库比对分析显示,差异基因共有627条,其中7条基因表达上调,620条基因表达下调,483条基因存在不同类型可变剪接。GO分类及KEGG通路分析表明:差异表达基因涉及多种食管癌肿瘤信号通路NF-κB、Wnt、Hedgehog,且与ESCC发生发展的进程相关。结论丹参酮ⅡA促进Eca109细胞凋亡分子机制可能与下调肿瘤信号通道相关,也进一步为ESCC治疗提供新依据。
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