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目的了解深圳市突发公共卫生事件的流行病学特征，为预防、控制及有效处理突发公共卫生事件提供科学依据。方法收集2006年深圳市突发公共卫生事件疫情报告数据与资料，进行汇总和流行病学特征分析。结果2006年深圳市突发公共卫生事件发生20起、报告病例338例，事件类型以传染病爆发疫情为主，占90％，事件发生场所主要在学校。结论突发公共卫生事件严重危害市民的身体健康和生命安全，学校是突发公共卫生事件的防控重点。