河流型水牛TGF-β基因家族鉴定及其胚胎发育早期的表达分析

来源 :中国畜牧兽医 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zwj123zwj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究旨在鉴定河流型水牛中转化生长因子-β (transforming growth factor-β,TGF-β)基因家族成员,分析该家族成员在胚胎发育早期的表达情况,并讨论其可能的作用.根据人类中已鉴定的TGF-β基因家族信息,通过BLASTP在河流型水牛全基因组层面鉴定TGF-β家族成员,同时对牛、山羊和小鼠的TGF-β家族信息进行鉴定,结合5个物种中的TGF-β基因家族信息构建系统进化树.根据河流型水牛胚胎发育早期4个阶段(2-细胞、8-细胞、桑椹胚和囊胚期)的RNA-seq数据分析,通过FPKM(Fragment of Per Kilobase of exon model per Millionmapped reads)值计算TGF-β家族成员的表达情况.结果 显示,根据人类中的33个TGF-β基因,分别在河流型水牛、牛、山羊和小鼠的基因组中鉴定出32、23、32和26个TGF-β基因,几个物种中TGF-β基因家族成员数量相近且在系统进化树中分布均匀,说明该家族在各个物种中具有分布和功能的保守性.在河流型水牛的32个TGF-β基因中,21个TGF-β基因家族成员在胚胎发育早期不表达或极低剂量表达,6个分化抑制因子低剂量表达,5个高表达的TGF-β基因均有报道过与繁殖过程相关,说明在河流型水牛的胚胎发育早期只有部分成员(5/32)参与其中行使功能,绝大多数的TGF-β基因(27/32)并没有参与其中.本研究结果为河流型水牛中TGF-β基因家族研究提供了数据基础,并为TGF-β基因家族在胚胎发育早期的功能研究提供了理论依据.
其他文献
目的:通过观察变应性鼻炎肺气虚寒证患儿治疗前后症状、体征积分变化,进一步肯定辛香喷鼻纳米乳剂治疗儿童变应性鼻炎肺气虚寒证的临床疗效和安全性,为治疗儿童变应性鼻炎提供
试验旨在研究3种转染方法对猪肾上皮细胞(PK15)的转染效率,为以PK15细胞为模型研究外源基因的功能提供参考.本研究以PK15细胞为研究对象,用脂质体、电穿孔、慢病毒3种转染方
目的:观察加味柴芍六君颗粒(jwcslj)对溃疡性结肠炎(UC)患者的临床疗效及对血清肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平的影响,从基础和临床研究方面系统探讨该方的作用机制。  方法:本研究
本研究旨在确定猪流行性腹泻病毒(PEDV)变异株CH/GX/750A/2015株在Vero细胞上转瓶培养的最佳条件,为大规模生产高效PEDV变异株疫苗提供技术支撑.试验以10 L转瓶培养病毒,对接
目的:观察茵陈解毒逐瘀汤灌肠辅助治疗慢性乙型重型肝炎的疗效.初步探讨其作用机制,建立防治慢性重型肝炎的中医药疗法。   方法:选择慢性乙型重型肝炎(早、中期)患者,随机分为
目的:  通过对糖尿病前期病例对照研究,得出糖尿病前期的中医病理体质类型,同时进一步明确糖尿病前期的中医病理体质类型与客观指标的相关性,从而丰富糖尿病前期的病因病机,为治