【摘 要】
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使用连续溶剂模型方法研究了SH2结构域与磷酸化多肽pYXXX（X为20种常见氨基酸残基中的任意一种）之间的相互作用.首先计算了已知的SH2域-磷酸化酪氨酸多肽复合物之间的结合能,理
【机 构】
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四川大学化工学院,四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室
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使用连续溶剂模型方法研究了SH2结构域与磷酸化多肽pYXXX（X为20种常见氨基酸残基中的任意一种）之间的相互作用.首先计算了已知的SH2域-磷酸化酪氨酸多肽复合物之间的结合能,理论计算的结果与实验测得的亲合能之间的相关系数为0.91,验证了理论模型的正确性.然后,用该模型方法计算了SH2域与pYXXX之间的结合能,分析了磷酸化酪氨酸多肽pYXXX中＋1,＋2,＋3位置上残基对结合能的影响.结果表明＋2,＋3位置上残基的变化对结合能影响较大,＋2位置上带负电的残基和＋3位置上的疏水性残基有利于SH2域与p
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