2014—2017年泉州地区急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的病原特征

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:syhlgs
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目的

分析泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎疫情的病原学特征。

方法

收集泉州地区2014—2017年15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情期间的患者标本,采用实时荧光定量PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ型、扎如病毒、星状病毒及轮状病毒,对检测结果进行统计学分析;诺如病毒检测阳性的标本,对其多聚酶和衣壳蛋白基因VP1区进行PCR扩增并测序,并用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析。

结果

本研究共采集96份来源于15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情的患者临床标本,共检出诺如病毒30份,阳性率为31.25%,其中GⅡ型23份、GⅠ型7份;随机选择10份阳性标本进行核酸序列分析,其中9份为GⅡ.P16/ GⅡ.2亚型,1份GⅠ.6亚型。系统进化树分析表明该GⅡ.P16/ GⅡ.2亚型诺如病毒新重组株与近期国内外暴发流行的GⅡ.P16/ GⅡ.2亚型高度同源。

结论

引起泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎暴发疫情的主要病原为诺如病毒GⅡ.P16/ GⅡ.2亚型和GⅠ.6亚型;其中GⅡ.P16/ GⅡ.2亚型在泉州地区首次出现,为近期优势毒株。

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