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目的
比较3款常用图像分析软件对细胞因子矩阵(Cytokine Array)相同任意蛋白点表达的差异，优选出最适图像分析软件。
方法从本实验室获得的一对Cytokine Array图像，任选图上4个蛋白点，以3款图像分析软件(Gel-Pro analyzer/Labwork、Quantity One和Image J)反复分析其蛋白丰度，比较其复杂性和可重复性，并针对入选蛋白，行酶联免疫吸附试验(ELISA)对比验证其吻合程度。
结果3款分析软件分析过程的复杂程度由简到繁依次为Gel-Pro analyzer/Labwork、Quantity One和Image J；可重复性从大到小(即变异系数从小到大)依次为Gel-Pro analyzer/Labwork(0.00%)、Quantity One(5.07%)和Image J(9.75%)；若以ELISA(81.49%)结果为标准参考值，则吻合度从高到低依次为Quantity One(71.61%)、Image J(67.27%)、Gel-Pro analyzer/Labwork(62.31%)。
结论各种软件均具备独自特点，如果仅作定性分析，推荐Gel-Pro analyzer/Labwork；如果作半定量分析，推荐Quantity One。若综合可重复性、分析过程的复杂程度、与ELISA结果的吻合程度，则推荐Quantity One。