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一种基于能量的RNA二级结构预测的动态划分算法
一种基于能量的RNA二级结构预测的动态划分算法
来源 :数学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lfshiyi
【摘 要】
:
预测单链RNA分子序列的二级结构是计算生物学中的一个重要内容.本文基于RNA分子结构的稳定性原理,提出了一种预测RNA二级结构的新算法--基于能量的动态划分算法.该算法的空间
【作 者】
:
高琼
莫忠息
郑卓
【机 构】
:
武汉大学数学与统计学院,武汉大学电信学院
【出 处】
:
数学杂志
【发表日期】
:
2003年1期
【关键词】
:
能量
RNA
二级结构
预测
动态划分算法
茎区
自由能
RNA secondary structure
dynamic patitioning algori
【基金项目】
:
武汉大学校科研和教改项目
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预测单链RNA分子序列的二级结构是计算生物学中的一个重要内容.本文基于RNA分子结构的稳定性原理,提出了一种预测RNA二级结构的新算法--基于能量的动态划分算法.该算法的空间复杂度仅为O(n),时间复杂度近似为O(n2·logn),且预测结构有较好的精度.
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