农村禀赋差异是农户合作社参与中政府和学界最为关注的内容之一.在影响农户参与合作社的影响因素中,合作社效率最为关键.本文利用西藏入户调查数据,借助异构选择有序Logit模型对农户合作社参与意愿的影响因素进行了分析.研究发现:西藏农村基本完成了“一村一社”,牧业村农户合作社参与意愿较强;不同禀赋村庄,经济效率认知均对农户合作社参与意愿存在显著的正向影响,社会效率认知对近郊农业村农户存在显著正向影响,交易效率认知对远郊农业村和牧业村农户存在显著正向影响.因而,通过统购统销的形式,降低农户生产成本,提高合作社的经济效率.同时,在远郊农村和牧业村,增加合作社与外界企业、超市的对接,丰富合作社农牧产品销售能力;在近郊农村,拓展合作社的辐射面,强化合作社社会责任,提高合作社区域形象和影响力,能够有效提高农户合作社参与意愿.此外,增加农户文化与技能培训对提高农户合作社参与也有现实意义.