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目的 了解海南地区结核分枝杆菌不同基因型流行特征,探讨基因分型用于评价本地区结核病控制中的应用价值.方法 本研究选取海南医学院第二附属医院自2013-2016年所有培养阳性结核分枝杆菌484株,采用SNP和Gao等推荐的12位点可变数目串联重复序列(variable number tandem repeat,VNTR)进行基因分型.结果 2013-2016年期间,484株结核分枝杆菌菌株中,北京基因型菌株279株,占57.6％,非北京基因型菌株205株,占42.4％,北京基因型菌株中包括91株(32.6％)古代北京基因型和188株(67.4％)现代北京基因型.北京基因型所占比例在四年间无显著变化,从2013年的59.6％到2016年的57.6％.采用3个高变VNTR位点基因分型后,成簇菌株数为0.结论 海南地区结核分枝杆菌存在明显的VNTR基因多态性,主要流行株仍以北京基因型为主,北京基因型所占比例在四年期间无显著性变化,且菌株成簇率较低,提示近期传播率低.