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全基因组关联分析目前已经成为研究复杂性状和疾病遗传变异的有效方法,但是由于群体结构的存在,导致分析结果出现虚假关联。经过数十年的发展,各种新方法不断出现和完善,用于减少群体结构对分析的影响。本综述将对在全基因组关联分析中能够处理群体结构的方法进行介绍,以期为进一步选择GWAS方法准确揭示各种性状的遗传背景提供参考。