青藏高原藏羚羊粪便携带小双节RNA病毒调查分析的研究

来源 :中国人兽共患病学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：smilepk

【摘要】

：

目的调查小双节RNA病毒(Picobirnavirus,PBV)在藏羚羊粪便中的携带情况,并对序列进行分析。方法提取160份藏羚羊粪便样品总RNA,利用转录组测序得到藏羚羊PBV序列,并且采用巢

【作者】

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戴琰罗雪莲杨晶朱文涛濮吉卢珊熊衍文徐建国

【机构】

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广西医科大学公共卫生学院,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

【出处】

：

中国人兽共患病学报

【发表日期】

：

2021年3期

【关键词】

：

藏羚羊小双节RNA病毒转录组测序核糖体结合位点 Tibetan antelope(Pantholops hodgsonii) Picobimavirus(

【基金项目】

：

国家自然科学基金(No.81802017),国家重大专项课题(No.2018ZX10712001-018)

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目的调查小双节RNA病毒(Picobirnavirus,PBV)在藏羚羊粪便中的携带情况,并对序列进行分析。方法提取160份藏羚羊粪便样品总RNA,利用转录组测序得到藏羚羊PBV序列,并且采用巢式RT-PCR验证大于1500 nt接近全长的序列。基于藏羚羊PBV的RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)氨基酸序列构建系统进化树;提取藏羚羊PBV起始密码子上游20个核苷酸,分析核糖体结合位点(ribosomal binding site,RBS)在5′非

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